少年錦衣衛完整版講述的是大明王朝，皇帝疏于朝政，宦官當權，黨爭激烈。江湖中正道難持，盜匪 猖獗，群盜之中最有名的便是“三盜”。冥火僧善用火藥，殘忍暴戾；千面狐花道常擅長易容，狡詐多變；白衣段云風流儒雅，輕功天下無雙。 三盜齊聚，冥火僧提出賭賽，入皇宮盜寶，以所盜物品定勝負，贏了就是 當世“盜圣”。三盜一拍即合，花道常最先下手，以易容術扮作王貴妃迷惑皇帝，偷得九龍杯。段云明為盜寶，實則是為在皇宮中尋找有關“天工印記” 的訊息，在尋找的過程中，他無意間被公主阿九撞見，阿九被段云吸引，一 路跟隨；冥火僧沿途縱火，為方便自己行事甚至引燃煙花意圖暴露段云與花道常的行跡，而他則直奔天書閣，為的獲得就是傳說中的天書《天工開物》兵之卷，江湖傳言，得此天書便可得天下。少年袁小棠身為北鎮撫司指揮使袁笑之的獨生兒子，剛當上錦衣衛不久，便因為不服命令，打傷上司，被關在牢中反省思過。也因此，在牢中和神秘犯人成為朋友，學得一套詭異的武功。袁笑之發現兒子不學無術，在武場上嚴厲懲戒，卻被皇城中冥火僧放出的煙花打斷，眼見皇城驚變，小棠一心能要證明自己，立得大功……